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微生物发酵是在一定条件下进行的,由于发酵过程的复杂性,实现药品质量的过程控制较化学合成反应的复杂程度要大,特别是控制抗生素等次级代谢产物的发酵就更为困难,因为微生物细胞在发酵过程中要进行上百个酶反应,并受到各式各样的调控机制的影响,它们之间还会相互制约,如果某个反应受阻,有可能影响整个代谢的变化,因此,有时外界因素的微小变化即对目标物的生成产生显著影响,因此,研究菌体的泥养规律、探讨生产菌对环境条件的要求和代谢变化的规律十分必要,通过调控与发酵条件和微生物细胞代谢变化有关的各项数,来有效控制发酵过程,使生产菌的代谢变化按照人们需要的方向进行,达到预期目的.培养基的优化以及发酵工艺的过程控制对于保障产品质量十分重要,通常调控的与微生物发酵有关的参数可分为物理、化学和生物三类,另外,还要通过代谢曲线、对次级代谢进行调控以及发酵起点的男断等过程控制措施共同掌握产品质量.